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本發(fā)明涉及一種棉花單位點(diǎn)質(zhì)量基因在染色體的快速定位方法,屬于生物技術(shù)領(lǐng)域。利用海陸F2定位群體構建的近等基因混池,篩選獲得具有多態(tài)性的引物,而后檢測隱性基因混池的9個(gè)單株、P-1、P-2以及F1的DNA,逐一記錄它們的帶型。據此,統計隱性混池的9個(gè)單株與隱性親本P-1的帶型一致的個(gè)體數,計算擬合率。選出與P-1帶型擬合率在60%以上,且F1帶型為顯性帶或共顯性帶的多態(tài)性引物,然后用這少量的似然引物檢測F2分離群體,統計帶型,軟件分析,即獲得與該質(zhì)量基因連鎖的SSR引物。實(shí)施例顯示,該方法使利用F2定位群體篩選目標連鎖引物的范圍縮減達90%以上;可快速鎖定與目的質(zhì)量基因連鎖的SSR引物,有效地減輕了基因定位的工作量,極大地提升了質(zhì)量基因在染色體的定位效率。